Partage d'environnement

Sauvegarder un environnement est une bonne pratique. Le fichier de sauvegarde généré est très léger et vous permettra de partager l'environnement avec des collaborateurs ou de réutiliser facilement le même environnement sur un autre ordinateur.

En fonction de la manière dont vous avez sauvegardé votre environnement, c'est-à-dire

conda env export > environment.yml
conda env export --from-history > environment.yml
conda env export --no-builds > environment.yml

vous aurez une section channels en haut :

channels:
- conda-forge
- bioconda

Les informations contenues dans la section channels sont prioritaires sur les canaux configurés dans votre fichier de configuration local de conda (.condarc). Lors de la construction d'un environnement à partir de ce fichier, si un paquet n'est pas trouvé parmi les canaux listés, alors les canaux définis dans votre configuration locale de conda (.condarc) seront utilisés.

Lorsque vous partagez le fichier avec quelqu'un d'autre, si cette personne n'a pas désactivé le canal defaults dans sa configuration conda locale, elle peut utiliser le canal defaults sous licence anaconda.

Pour éviter ce problème, vous devriez ajouter le canal - nodefaults dans la section channels de votre environnement yaml sauvegardé, ce qui désactivera le canal defaults de la configuration locale de conda (.condarc) de l'ordinateur qui l'utilise.

Pour plus de détails, voir la documentation pertinente de conda.